Una pequeña proporción de los pacientes que no podían tolerar previamente la sulfasalazina reportan efectos adversos con el uso de ASACOL^®. Los efectos adversos son predominantemente de carácter gastrointestinal (náusea, vómito, pancreatitis, hepatitis, exacerbación de los síntomas de colitis, diarrea o dolor abdominal), así como dolor de cabeza, vértigo, y fiebre. Se han reportado raras veces leucopenia, neutropenia, trombocitopenia, anemia aplástica, pancreatitis, hepatitis, pericarditis, miocarditis, broncoespasmo, reacciones pulmonares alérgicas, neumonía eosinofilica, nefritis intersticial, síndrome nefrótico e insuficiencia renal con el tratamiento oral. La insuficiencia renal puede ser reversible con la discontinuación del tratamiento.

Se han reportado raros casos de alopecia. Algunos de estos probablemente relacionados a la naturaleza auto inmune de la enfermedad de fondo inflamatoria intestinal. Una rara complicación es el lupus inducido por medicamentos con pericarditis y pleuropéricarditis como síntomas predominantes así como rash y artralgia.